
Hälsohögskolan: Hälsa, vård och socialt arbete med samhällsrelevans och högsta kvalitet.
Högskolan för lärande och kommunikation: Innovativt lärande, specialpedagogik och ett nationellt centrum för livslångt lärande.
Internationella Handelshögskolan: Internationalisering, entreprenörskap och näringslivsförnyelse samt ett internationellt centrum för media.
Tekniska Högskolan: En unik inriktning på produktframtagning i mindre och medelstora företag, robusta och intelligenta produkter, ett europeiskt centrum för gjutning.
Högskolan i Jönköping har etablerat nyckelrelationer med internationella partners.
Äldreforskningen vid Hälsohögskolan sker i nära samarbete med Karolinska Institutet, Pennsylvania State University och University of Southern California. Hälsohögskolan deltar även i forskarnätverk kring äldrefrågor med bl.a. University of North Carolina at Chapel Hill, Australian National University at Canberra och University of Jyväskylä. Inom omvårdnad pågår forskningssamarbete med bl.a. universitet i Sydafrika, Storbritannien och Kina.
Forskningsprogrammet CHILD understöds bl.a. av EU-medel och knyter Hälsohögskolan och Högskolan för lärande och kommunikation till betydande forskarnätverk i Europa och USA. Genom Encell medverkar Högskolan för lärande och kommunikation i de internationella nätverken International Research Group on Social Representations and Transformation of Knowledge samt Foucauldian Studies of Adult Learning.
Internationella Handelshögskolan medverkar i väletablerade internationella nätverk genom det årliga Uddevallasymposiet och den ledande entreprenörskapskonferensen Babson Kauffman Entrepreneurship Research Conference samt det globala forskningsinitiativet STEP.
Tekniska Högskolan samarbetar internationellt med en rad universitet och forskningsinstitut i olika forskningsprogram. Exempelvis finns ett nära samarbete med University of Queensland, Brisbane, Australien, inom gjuteriområdet samt Fraunhofer ISST, Berlin, som har etablerat en betydande filial inom Information Engineering vid Tekniska Högskolan.
Studentutbytet är mycket omfattande: 40 procent av högskolans studenter reste utomlands via utbytesprogram 2009; att jämföra med riksgenomsnittet 17 procent (Källa: HSV). Vid Internationella Handelshögskolan studerar nära 90 procent av studenterna utomlands minst en termin. Cirka 1 300 internationella studenter deltar i högskolans utbildningar som utbytesstudenter eller som s.k. free movers.
Inom grundutbildningen sker samverkan med näringslivet genom de 800 fadderföretag som ger programstudenter vid Internationella Handelshögskolan och Tekniska Högskolan en stabil företagskontakt under de två första åren av sin studietid. Det visar sig också i den höga externforskningsandelen, 63 procent 2010. Riksgenomsnittet för 2009 var 56,3 procent (Källa: HSV).
Den långa praktiken, 20-25 veckor, i lärar- och vårdutbildningarna respektive ett väl utvecklat samarbete med regionens skolor och sjukhus grundar för ett brett samarbete i såväl grundutbildningen som uppdragsverksamhet.
Som ett led i fokuseringen på entreprenörskap skapar Högskolan i Jönköping unika förutsättningar för studenterna vid samtliga fackhögskolor att starta egna företag redan under studietiden, bl.a. genom Business Lab vid Science Park Jönköping. Under 2011 startades där runt 75 företag av högskolans studenter.
Därtill utvecklas "senior lab" för idéutveckling kring äldre och åldrande för att finna nya och kreativa lösningar kring service och omsorg samt "learning lab" i syfte att utveckla en entreprenöriell beredskap och förmåga att bl.a. möta skolvärldens dynamiska förändringar. Vid International Academy of Entrepreneurship, ett globalt forum och mötesplats för entreprenörer från hela världen, skapas möjligheter för internationellt entreprenörskap.